微囊藻毒素是一種具有自我強(qiáng)化機(jī)制作用的生態(tài)生長(zhǎng)調(diào)節(jié)素，高濃度MC可以影響水生植物種類(lèi)的多樣性，從而幫助藍(lán)藻獲得競(jìng)爭(zhēng)優(yōu)勢(shì)，直至形成水華。水生植物則直接受到水體中的MC影響，并可能通過(guò)他感作用（allelopathy）與產(chǎn)生毒素的藻類(lèi)發(fā)生相互作用。在MC對(duì)植物的毒性作用機(jī)制中，磷酸酶抑制途徑可能并不重要，而ROS的誘導(dǎo)升高可能是其主要的致毒機(jī)理。經(jīng)MC-RR處理后，細(xì)長(zhǎng)聚球藻（Synechococcuselongatus）的生長(zhǎng)明顯受到抑制，ROS水平升高引發(fā)氧化脅迫，導(dǎo)致丙二醛（MDA）含量顯著升高。MC-LR誘導(dǎo)甲藻（Peridiniumgatunense）產(chǎn)生的氧化應(yīng)激與MAPKs旁路關(guān)鍵酶的激活有著密切關(guān)系。

　　微囊藻毒素的毒性，具有明顯的器官選擇性。*的是對(duì)人體肝臟的毒性。大量的流行病學(xué)研究表明，當(dāng)?shù)仫嬘盟械奈⒛以宥舅睾颗c當(dāng)?shù)卦l(fā)性肝癌的發(fā)病率有很大的相關(guān)性。

　　微囊藻毒素除了強(qiáng)烈的肝臟和腎臟毒性外，越來(lái)越多的研究顯示，MCs還有一定的遺傳毒性和免疫毒性。

　　微囊藻毒素可以通過(guò)損傷DNA、染色體和基因等遺傳物質(zhì)，對(duì)機(jī)體造成危害。而目前免疫毒性研究，主要集中于其對(duì)免疫細(xì)胞核免疫分子的影響。動(dòng)物實(shí)驗(yàn)顯示，微囊藻毒素對(duì)小鼠免疫系統(tǒng)多個(gè)方面、多個(gè)層次的功能，顯示出明顯的抑制作用。